Organization and annotation of eukaryote genomes

  • Enseignement

    Détails

    Faculté Faculté des sciences et de médecine
    Domaine Biologie
    Code UE-SBL.30004
    Langues Anglais
    Type d'enseignement Cours bloc
    Cursus Master
    Semestre(s) SA-2021

    Titre

    Français Organisation et annotation des génomes eukaryotiques
    Allemand Organisation und Annotation von eukaryotischen Genomen
    Anglais Organization and annotation of eukaryote genomes

    Horaires et salles

    Horaire résumé Mercredi , Cours bloc (Semestre d'automne)
    Struct. des horaires cours bloc
    Heures de contact 48

    Enseignement

    Responsables
    • Parisod Christian
    Enseignants
    • Parisod Christian
    Description

    (SBL.30004; 3 ECTS; lecture with exercises) This course examines the main evolutionary processes shaping the organization plant and animal genomes. It compares and operates complementary approaches to characterize gene models as well as transposable element in model and non-model organisms. Using adequate tools to identify duplicated sequences and ‘junk DNA’, it will also address how to benefit from genomic variation. A mix of lectures and practical exercises will enable students to take advantage of current approaches to robustly describe and understand Eukaryote genomes.

    Softskills Non
    Hors domaine Oui
    BeNeFri Oui
    Mobilité Oui
    UniPop Non
  • Dates et salles
    Date Heure Type d'enseignement Lieu
    20.10.2021 08:15 - 17:00 Cours VIL 01, salle STP
    27.10.2021 08:15 - 17:00 Cours VIL 01, salle STP
    03.11.2021 08:15 - 17:00 Cours VIL 01, salle STP
    10.11.2021 08:15 - 17:00 Cours VIL 01, salle STP
    17.11.2021 08:15 - 17:00 Cours VIL 01, salle STP
    24.11.2021 08:15 - 11:00 Cours PER 04, salle 0.110
    24.11.2021 13:15 - 17:00 Cours PER 04, salle 0.109
  • Modalités d'évaluation

    Rapport

    Mode d'évaluation Par note
    Description

    Written exam (90 min.). One mark

    Modification of the evaluation modality (SA2021): report. One mark. 

  • Affiliation
    Valable pour les plans d'études suivants:
    Biologie [3e cycle]
    Version: 2015_1/V_01
    Formation continue > UE de spécialisation en Biologie (niveau master)

    Biologie [POST-DOC]
    Version: 2015_1/V_01
    Formation continue > UE de spécialisation en Biologie (niveau master)

    Complément au doctorat [PRE-DOC]
    Version: 2020_1/v_01
    Complément au doctorat ( Faculté des sciences et de médecine) > UE de spécialisation en Biologie (niveau master)

    Enseignement complémentaire en sciences
    Version: ens_compl_sciences
    Paquet indépendant des branches > UE de spécialisation en Biologie (niveau master)

    MSc en Sciences moléculaires du vivant et de la santé, option Biochimie et biologie cellulaire 120 [MA]
    Version: 2022_1/V_01
    MSc en Sciences moléculaires du vivant et de la santé, option Biochimie et biologie cellulaire, cours et séminaires (dès SA2021) > MSc-ML, option Biochimie et biologie cellulaire, UE à choix (dès SA2021) > Cours optionnels

    MSc en Sciences moléculaires du vivant et de la santé, option Biologie du développement et régénération 120 [MA]
    Version: 2022_1/V_01
    MSc en Sciences moléculaires du vivant et de la santé, option Biologie du développement et régénération, cours et séminaires (dès SA2021) > MSc-ML, option Biologie du développement et régénération, UE à choix (dès SA2021) > Cours optionnels

    MSc en Sciences moléculaires du vivant et de la santé, option Biologie marine 120 [MA]
    Version: 2022_1/V_01
    MSc en Sciences moléculaires du vivant et de la santé, option Biologie marine, cours et séminaires (dès SA2021) > MSc-ML, option Biologie marine, UE à choix (dès SA2021) > Cours optionnels

    MSc en Sciences moléculaires du vivant et de la santé, option Enseignement 90 [MA]
    Version: 2023_1/V_01
    MSc en Sciences moléculaires du vivant et de la santé, option Enseignement, cours et séminaires (dès SA2021) > MSc-ML, option Enseignement, UE à choix (dès SA2023) > Cours optionnels

    MSc en Sciences moléculaires du vivant et de la santé, option Neurobiologie 120 [MA]
    Version: 2022_1/V_01
    MSc en Sciences moléculaires du vivant et de la santé, option Neurobiologie, cours et séminaires (dès SA2021) > MSc-ML, option Neurobiologie, UE à choix (dès SA2021) > Cours optionnels

    MSc en bioinformatique et biologie computationnelle [MA] 120
    Version: 2023_1/V_01
    MSc en bioinformatique et biologie computationnelle, cours > MSc-BI, Module “Genomics” (dès SA2020)

    MSc en biologie de l’environnement, option Biologie environnementale appliquée 120 [MA]
    Version: 2022_1/V_01
    MSc en biologie de l’environnement, option Biologie environnementale appliquée, cours et séminaires (dès SA2021) > MSc-EB, option Biologie environnementale appliquée, UE à choix (dès SA2022) > Cours optionnels

    MSc en biologie de l’environnement, option Enseignement 90 [MA]
    Version: 2023_1/V_01
    MSc en biologie de l’environnement, option Enseignement, cours et séminaires (dès SA2021) > MSc-EB, option Enseignement, UE à choix (dès SA2023) > Cours optionnels

    MSc en biologie de l’environnement, option Sciences végétales et microbiennes 120 [MA]
    Version: 2022_1/V_01
    MSc en biologie de l’environnement, option Sciences végétales et microbiennes, cours et séminaires (dès SA2021) > MSc-EB, option Sciences végétales et microbiennes, UE à choix (dès SA2022) > Cours optionnels

    MSc en biologie de l’environnement, option Écologie et évolution 120 [MA]
    Version: 2022_1/V_01
    MSc en biologie de l’environnement, option Écologie et évolution, cours et séminaires (dès SA2021) > MSc-EB, option Écologie et évolution, UE à choix (dès SA2022) > Cours recommandés