Classical models in biology (lecture)

  • Enseignement

    Détails

    Faculté Faculté des sciences et de médecine
    Domaine Biologie
    Code BL.6002
    Langues Anglais
    Type d'enseignement Cours
    Cursus Master
    Semestre(s) SP-2019

    Horaires et salles

    Horaire résumé vendredi 10:15 - 12:00, Hebdomadaire, PER 07 1.309
    Heures de contact 28

    Enseignement

    Responsables
    Enseignants
    Description Le cours commence par une analyse approfondie des modèles classiques en dynamique des populations. Ensuite, le modèle de Bernoulli pour la variole est abordé mathématiquement; il est complété par les modèles épidémiologiques simples. La mathématique des modèles du chémostat, des populations avec structure d'âge et de Luria-Delbrück est expliquée. Le cours finit par l'analyse de divers modèles décrivant les interactions entre espèces. Le cours introduit les concepts d'équations différentielles et aux différences finies, d'équilibre, de stabilité, d'espace de phase, de stabilité locale, de valeurs et vecteurs propres, et de modèles déterministes et stochastiques.

    The course starts with an in-depth analysis of classical models of population dynamics. It continues with the mathematical treatment of Bernoulli model of smallpox disease, and extends to epidemiological models. The mathematics of chemostat, age-structured, and Luria-Delbrück models are explained. The course ends with study of various models for systems of interacting species. The course introduces the concepts of differential and finite difference equations, equilibrium, stability, phase space, local stability analysis, eigenvalues and eigenvectors, and deterministic and stochastic models.
    Objectifs de formation Les étudiants seront capables de comprendre d'une manière critique les modèles classiques en biologie. Ils sauront lire et analyser les équations et évaluer leurs hypothèses de base, leurs porté et limitations. Ils auront acquis les connaissances nécessaires pour élaborer des modèles simples et pour communiquer avec les mathématiciens lors du développement de modèles plus complexes.

    Students will be able to critacally understand classical models in biology. They will be able to read and analyze equations, and to evaluate their assumptions, scope and limitations. They will acquire the necessary skills to elaborate simple models and to communicate and interact with mathematicians in the development of more complex models.
    Commentaire Remplace MA.6002
    Softskills
    Non
    Hors domaine
    Non
    BeNeFri
    Oui
    Mobilité
    Oui
    UniPop
    Non
  • Dates et salles
    Date Heure Lieu
    22.02.2019 10:15 - 12:00 PER 07 , salle 1.309
    01.03.2019 10:15 - 12:00 PER 07 , salle 1.309
    08.03.2019 10:15 - 12:00 PER 07 , salle 1.309
    15.03.2019 10:15 - 12:00 PER 07 , salle 1.309
    22.03.2019 10:15 - 12:00 PER 07 , salle 1.309
    29.03.2019 10:15 - 12:00 PER 07 , salle 1.309
    05.04.2019 10:15 - 12:00 PER 07 , salle 1.309
    12.04.2019 10:15 - 12:00 PER 07 , salle 1.309
    03.05.2019 10:15 - 12:00 PER 07 , salle 1.309
    10.05.2019 10:15 - 12:00 PER 07 , salle 1.309
    17.05.2019 10:15 - 12:00 PER 07 , salle 1.309
    24.05.2019 10:15 - 12:00 PER 07 , salle 1.309
  • Modalités d'évaluation

    Examen écrit - SP-2019, Session d'été 2019

    Date 17.06.2019 15:30 - 16:15
    Mode d'évaluation Par note
    Description Written (45 min.) or oral (20 min.) exam

    Examen écrit - SP-2019, Session d'automne 2019

    Date 30.08.2019 00:00 - 00:00
    Mode d'évaluation Par note
    Description Written (45 min.) or oral (20 min.) exam
  • Affiliation
    Valable pour les plans d'études suivants:
    Ens. compl. en Sciences
    Version: ens_compl_sciences
    Paquet indépendant des branches > UE de spécialisation en Biologie (niveau master)

    MSc en bioinformatique et biologie computationnelle [MA] 90
    Version: 2018_1/V_01
    MSc en bioinformatique et biologie computationnelle, cours > MSc en bioinformatique et biologie computationnelle, UE obligatoires (dès SA2018)

    MSc-BL, option Sciences moléculaires animales [MA] 90
    Version: 2018_1/V_01
    MSc en biologie, option Sciences moléculaires animales, cours et séminaires (dès SA2018) > MSc en biologie, option Sciences moléculaires animales, UE à choix (dès SA2018)

    Sciences biomédicales approfondies 30
    Version: 2018_1/V_01
    Sciences biomédicales approfondies (BMS-A), branche complémentaire 30 (dès SA2018) > Sciences biomédicales approfondies, branche complémentaire 30, UE obligatoires (dès SA2018)