Classical models in biology (lecture)

  • Enseignement

    Détails

    Faculté Faculté des sciences et de médecine
    Domaine Biologie
    Code UE-SBL.06002
    Langues Anglais
    Type d'enseignement Cours
    Cursus Master
    Semestre(s) SP-2020

    Horaires et salles

    Horaire résumé Vendredi 10:15 - 12:00, Hebdomadaire (Semestre de printemps)
    Heures de contact 28

    Enseignement

    Responsables
    • Bersier Louis-Félix
    Enseignants
    • Bersier Louis-Félix
    • Rohr Rudolf Philippe
    Description Le cours commence par une analyse approfondie des modèles classiques en dynamique des populations. Ensuite, le modèle de Bernoulli pour la variole est abordé mathématiquement; il est complété par les modèles épidémiologiques simples. La mathématique des modèles du chémostat, des populations avec structure d'âge et de Luria-Delbrück est expliquée. Le cours finit par l'analyse de divers modèles décrivant les interactions entre espèces. Le cours introduit les concepts d'équations différentielles et aux différences finies, d'équilibre, de stabilité, d'espace de phase, de stabilité locale, de valeurs et vecteurs propres, et de modèles déterministes et stochastiques.

    The course starts with an in-depth analysis of classical models of population dynamics. It continues with the mathematical treatment of Bernoulli model of smallpox disease, and extends to epidemiological models. The mathematics of chemostat, age-structured, and Luria-Delbrück models are explained. The course ends with study of various models for systems of interacting species. The course introduces the concepts of differential and finite difference equations, equilibrium, stability, phase space, local stability analysis, eigenvalues and eigenvectors, and deterministic and stochastic models.
    Objectifs de formation Les étudiants seront capables de comprendre d'une manière critique les modèles classiques en biologie. Ils sauront lire et analyser les équations et évaluer leurs hypothèses de base, leurs porté et limitations. Ils auront acquis les connaissances nécessaires pour élaborer des modèles simples et pour communiquer avec les mathématiciens lors du développement de modèles plus complexes.

    Students will be able to critacally understand classical models in biology. They will be able to read and analyze equations, and to evaluate their assumptions, scope and limitations. They will acquire the necessary skills to elaborate simple models and to communicate and interact with mathematicians in the development of more complex models.
    Commentaire Remplace MA.6002
    Softskills Non
    Hors domaine Non
    BeNeFri Oui
    Mobilité Oui
    UniPop Non
  • Dates et salles
    Date Heure Type d'enseignement Lieu
    21.02.2020 10:15 - 12:00 Cours PER 07, salle 1.309
    28.02.2020 10:15 - 12:00 Cours PER 07, salle 1.309
    06.03.2020 10:15 - 12:00 Cours PER 07, salle 1.309
    13.03.2020 10:15 - 12:00 Cours PER 07, salle 1.309
    20.03.2020 10:15 - 12:00 Cours PER 07, salle 1.309
    27.03.2020 10:15 - 12:00 Cours PER 07, salle 1.309
    03.04.2020 10:15 - 12:00 Cours PER 07, salle 1.309
    24.04.2020 10:15 - 12:00 Cours PER 07, salle 1.309
    01.05.2020 10:15 - 12:00 Cours PER 07, salle 1.309
    08.05.2020 10:15 - 12:00 Cours PER 07, salle 1.309
    15.05.2020 10:15 - 12:00 Cours PER 07, salle 1.309
    29.05.2020 10:15 - 12:00 Cours PER 07, salle 1.309
  • Modalités d'évaluation

    Examen écrit - SP-2020, Session d'été 2020

    Mode d'évaluation Par note
    Description

    COVID-19 – SP2020 / session d’examens ÉTÉ 2020 

    Examen écrit en ligne

    Durée : 45 minutes

     

    Written (45 min.) or oral (20 min.) exam

    Examen écrit - SP-2020, Session d'automne 2020

    Date 28.08.2020 08:00 - 00:00
    Mode d'évaluation Par note
    Description

    COVID-19 – SP2020 / session d’examens ÉTÉ 2020 

    Examen écrit en ligne

    Durée : 45 minutes

     

    Written (45 min.) or oral (20 min.) exam

    Commentaire Examen oral en présence de 20 minutes.
  • Affiliation
    Valable pour les plans d'études suivants:
    Biologie [3e cycle]
    Version: 2015_1/V_01
    Formation continue > UE de spécialisation en Biologie (niveau master)

    Biologie [POST-DOC]
    Version: 2015_1/V_01
    Formation continue > UE de spécialisation en Biologie (niveau master)

    Complément au doctorat [PRE-DOC]
    Version: 2020_1/v_01
    Complément au doctorat ( Faculté des sciences et de médecine) > UE de spécialisation en Biologie (niveau master)

    Enseignement complémentaire en sciences
    Version: ens_compl_sciences
    Paquet indépendant des branches > UE de spécialisation en Biologie (niveau master)

    MSc en Sciences de l'environnement et humanités environnementales [MA] 120
    Version: 2023_1/V_01
    MSc en Sciences de l'environnement et humanités environnementales, UE obligatoires > MSc-SE, Environmental Biology Module (dès SA2022)

    MSc en bioinformatique et biologie computationnelle [MA] 120
    Version: 2023_1/V_01
    MSc en bioinformatique et biologie computationnelle, cours > MSc-BI, Module “Bioinformatic Applications” (dès SA2020)

    MSc en biologie de l’environnement, option Biologie environnementale appliquée 120 [MA]
    Version: 2022_1/V_01
    MSc en biologie de l’environnement, option Biologie environnementale appliquée, cours et séminaires (dès SA2021) > MSc-EB, option Biologie environnementale appliquée, UE à choix (dès SA2022) > Cours recommandés

    MSc en biologie de l’environnement, option Enseignement 90 [MA]
    Version: 2023_1/V_01
    MSc en biologie de l’environnement, option Enseignement, cours et séminaires (dès SA2021) > MSc-EB, option Enseignement, UE à choix (dès SA2023) > Cours recommandés

    MSc en biologie de l’environnement, option Sciences végétales et microbiennes 120 [MA]
    Version: 2022_1/V_01
    MSc en biologie de l’environnement, option Sciences végétales et microbiennes, cours et séminaires (dès SA2021) > MSc-EB, option Sciences végétales et microbiennes, UE à choix (dès SA2022) > Cours recommandés

    MSc en biologie de l’environnement, option Écologie et évolution 120 [MA]
    Version: 2022_1/V_01
    MSc en biologie de l’environnement, option Écologie et évolution, cours et séminaires (dès SA2021) > MSc-EB, option Écologie et évolution, UE obligatoires (dès SA2022)

    Sciences biomédicales approfondies 30
    Version: 2022_1/V_01
    Sciences biomédicales approfondies (BMS-A), branche complémentaire 30 (dès SA2020) > Sciences biomédicales approfondies, branche complémentaire 30, UE obligatoires (dès SA2018)