Metagenomics data analysis

  • Enseignement

    Détails

    Faculté Faculté des sciences et de médecine
    Domaine Biologie
    Code UE-SBL.00425
    Langues Anglais
    Type d'enseignement Cours
    Cursus Master
    Semestre(s) SP-2020

    Titre

    Français Analyse de données métagénomiques
    Allemand Analyse von Metagenomischen Daten
    Anglais Metagenomics data analysis

    Horaires et salles

    Horaire résumé Mardi 13:15 - 15:00, Hebdomadaire (Semestre de printemps)

    Enseignement

    Responsables
    • Falquet Laurent
    Enseignants
    • Falquet Laurent
    Description

    Students will learn the basic principles of metagenomics data analysis and their associated methods. The course will cover the targeted methods (16S, ITS) as well as the Whole Genome/Transcriptome Sequencing methods, both in prokaryotes and eukaryotes. Students will learn which kind of data could be extracted from metagenomics analysis and how to analyze and represent these data.

    Conditions d'accès

    Prerequisite: BC.7106

    Softskills Non
    Hors domaine Non
    BeNeFri Non
    Mobilité Non
    UniPop Non
  • Dates et salles
    Date Heure Type d'enseignement Lieu
    18.02.2020 13:15 - 15:00 Cours PER 01, salle 0.367
    25.02.2020 13:15 - 15:00 Cours PER 01, salle 0.367
    03.03.2020 13:15 - 15:00 Cours PER 01, salle 0.367
    10.03.2020 13:15 - 15:00 Cours PER 01, salle 0.367
    17.03.2020 13:15 - 15:00 Cours PER 01, salle 0.367
    24.03.2020 13:15 - 15:00 Cours PER 01, salle 0.367
    31.03.2020 13:15 - 15:00 Cours PER 01, salle 0.367
    07.04.2020 13:15 - 15:00 Cours PER 01, salle 0.367
    21.04.2020 13:15 - 15:00 Cours PER 01, salle 0.367
    28.04.2020 13:15 - 15:00 Cours PER 01, salle 0.367
    05.05.2020 13:15 - 15:00 Cours PER 01, salle 0.367
    12.05.2020 13:15 - 15:00 Cours PER 01, salle 0.367
    19.05.2020 13:15 - 15:00 Cours PER 01, salle 0.367
    26.05.2020 13:15 - 15:00 Cours PER 01, salle 0.367
  • Modalités d'évaluation

    Examen - SP-2020, Session d'été 2020

    Mode d'évaluation Par note
    Description

    COVID-19 – SP2020 / session d’examens ÉTÉ 2020 

    Examen oral en ligne

    Durée : 20 minutes

     

     

    Oral (20 min) or written (60 min) exam

    Examen - SP-2020, Session d'automne 2020

    Mode d'évaluation Par note
    Description

    COVID-19 – SP2020 / session d’examens ÉTÉ 2020 

    Examen oral en ligne

    Durée : 20 minutes

     

     

    Oral (20 min) or written (60 min) exam

  • Affiliation
    Valable pour les plans d'études suivants:
    Biologie [3e cycle]
    Version: 2015_1/V_01
    Formation continue > UE de spécialisation en Biologie (niveau master)

    Biologie [POST-DOC]
    Version: 2015_1/V_01
    Formation continue > UE de spécialisation en Biologie (niveau master)

    Complément au doctorat [PRE-DOC]
    Version: 2020_1/v_01
    Complément au doctorat ( Faculté des sciences et de médecine) > UE de spécialisation en Biologie (niveau master)

    Enseignement complémentaire en sciences
    Version: ens_compl_sciences
    Paquet indépendant des branches > UE de spécialisation en Biologie (niveau master)

    MSc en Sciences moléculaires du vivant et de la santé, option Biochimie et biologie cellulaire 120 [MA]
    Version: 2022_1/V_01
    MSc en Sciences moléculaires du vivant et de la santé, option Biochimie et biologie cellulaire, cours et séminaires (dès SA2021) > MSc-ML, option Biochimie et biologie cellulaire, UE à choix (dès SA2021) > Cours recommandés

    MSc en Sciences moléculaires du vivant et de la santé, option Biologie du développement et régénération 120 [MA]
    Version: 2022_1/V_01
    MSc en Sciences moléculaires du vivant et de la santé, option Biologie du développement et régénération, cours et séminaires (dès SA2021) > MSc-ML, option Biologie du développement et régénération, UE à choix (dès SA2021) > Cours optionnels

    MSc en Sciences moléculaires du vivant et de la santé, option Biologie marine 120 [MA]
    Version: 2022_1/V_01
    MSc en Sciences moléculaires du vivant et de la santé, option Biologie marine, cours et séminaires (dès SA2021) > MSc-ML, option Biologie marine, UE à choix (dès SA2021) > Cours optionnels

    MSc en Sciences moléculaires du vivant et de la santé, option Enseignement 90 [MA]
    Version: 2023_1/V_01
    MSc en Sciences moléculaires du vivant et de la santé, option Enseignement, cours et séminaires (dès SA2021) > MSc-ML, option Enseignement, UE à choix (dès SA2023) > Cours optionnels

    MSc en Sciences moléculaires du vivant et de la santé, option Neurobiologie 120 [MA]
    Version: 2022_1/V_01
    MSc en Sciences moléculaires du vivant et de la santé, option Neurobiologie, cours et séminaires (dès SA2021) > MSc-ML, option Neurobiologie, UE à choix (dès SA2021) > Cours optionnels

    MSc en bioinformatique et biologie computationnelle [MA] 120
    Version: 2023_1/V_01
    MSc en bioinformatique et biologie computationnelle, cours > MSc-BI, Module “Genomics” (dès SA2020)

    MSc en biologie de l’environnement, option Biologie environnementale appliquée 120 [MA]
    Version: 2022_1/V_01
    MSc en biologie de l’environnement, option Biologie environnementale appliquée, cours et séminaires (dès SA2021) > MSc-EB, option Biologie environnementale appliquée, UE à choix (dès SA2022) > Cours recommandés

    MSc en biologie de l’environnement, option Enseignement 90 [MA]
    Version: 2023_1/V_01
    MSc en biologie de l’environnement, option Enseignement, cours et séminaires (dès SA2021) > MSc-EB, option Enseignement, UE à choix (dès SA2023) > Cours optionnels

    MSc en biologie de l’environnement, option Sciences végétales et microbiennes 120 [MA]
    Version: 2022_1/V_01
    MSc en biologie de l’environnement, option Sciences végétales et microbiennes, cours et séminaires (dès SA2021) > MSc-EB, option Sciences végétales et microbiennes, UE à choix (dès SA2022) > Cours recommandés

    MSc en biologie de l’environnement, option Écologie et évolution 120 [MA]
    Version: 2022_1/V_01
    MSc en biologie de l’environnement, option Écologie et évolution, cours et séminaires (dès SA2021) > MSc-EB, option Écologie et évolution, UE à choix (dès SA2022) > Cours optionnels